配备尼康A1MP共聚焦显微镜，A1MP共聚焦显微镜具有高速与高质兼备，独有同步光活化、高灵敏度NDD深部成像、超高灵敏度GaAsP NDD探测器等优点，A1MP共聚焦显微镜可使用1300nm红外激光，提供前所未有更深层的高灵敏度成像。配备多光子四通道NDD探测器能够有效地进行标本深部的显微成像，较普通探测器而言，NDD的感光元件面积更大，灵敏度更高。该配置有效地提高了对散射荧光的探测效率，具有更高的信噪比，实现活体小鼠的深部脑组织成像。此外，拥有冰冻切片机、振动切片机和尼康Ni-E全电动荧光显微镜系统等全套组织形态学实验设备。尼康Ni-E全电动荧光显微镜系统可在一台显微镜上同时安装两条光路，该结构支持双层安装和分别控制激发滤光片转盘和发射滤光片转盘，支持多种组织学图像拍摄。